A comunidade de São Sebastião se torna paróquia na década de 1960 mas sua história começa ainda no século XIX, quando o humilde e cristão Claudino Antônio Araújo faz uma promessa pedindo a intercessão do mártir na proteção da cidade de Amparo durante a epidemia de Febre Amarela, que vitimava a região. No ano de 1893, com bênção do padre João Manuel de Carvalho, então responsável pela Paróquia de Nossa Senhora do Amparo, começava a construção da nossa atual Matriz Centenária.
O terreno onde foi construída a capela foi doado pelo casal Florêncio Franco da Rocha e Maria Franco da Rocha, proprietários da Chácara Ribeirão, e a escritura foi lavrada no dia 25 de setembro de 1893, com a obrigatoriedade de que as obras começassem dentro de 12 meses. Claudino percorria as ruas batendo de porta em porta com uma sacola vermelha pedindo ajuda para a construção.
Com o considerável aumento da população, resultado do êxodo rural e do processo de industrialização que se acentuava, a cidade de Amparo prosperava e crescia em direção ao Bairro do Ribeirão.
Nesse contexto, era evidente a necessidade de uma nova paróquia. Com grande visão pastoral, Monsenhor João Baptista Lisboa, pároco de Nossa Senhora do Amparo, encaminhou ao Bispo de Campinas, Dom Paulo de Tarso Campos, o pedido para a criação de uma nova paróquia.
Com o desenvolvimento da comunidade, a antiga matriz já não era suficiente para todos os fiéis. Com isso, logo que assumiu como pároco, Pe. Francisco de Paiva Garcia iniciou os trabalhos para a construção da nova Matriz de São Sebastião. No livro tombo, anotou “Muito entusiasmo por parte da população que participa com euforia dessa empreitada”. O projeto da Igreja Matriz e da nova Casa Paroquial são assinados pelo arquiteto espanhol Victor Pelaez Liera. A construção começou em 1969 e a primeira missa na nova matriz aconteceu no dia 24 de dezembro de 1971, sendo que o término total da obra aconteceu no início da década de 1980.
Outros foram os projetos realizados pelo Pe. Francisco, segundo o Arquiteto Victor e a ajuda constante do povo, as futuras Matrizes de Nossa Senhora Aparecida de Arcadas, São José Operário no Jardim São Dimas e o início das obras do Centro de Pastoral São João Paulo II em nossa Paróquia.
