Criada em 27 de fevereiro de 1967, a Paróquia São Francisco de Assis na cidade de Serra Negra foi desmembrada da Paróquia Nossa Senhora do Rosário, tendo por sua vez todos os direitos de Matriz. Este decreto fora autorizado por Dom Paulo de Tarso Campos, na época, Arcebispo Metropolitano de Campinas. Sendo assim, toma posse da paróquia no dia 14 de março de 1967 como primeiro Vigário, o padre Antonio Maffei, missionário da Consolata.
Neste período não havia casa paroquial, sendo que o padre morava provisoriamente em um apartamento do Asilo São Francisco de Assis. No ano de 1970 fora então adquirido pela paróquia, um terreno ao lado da Igreja Matriz para a construção da casa e do salão paroquial. Ambas as construções foram iniciadas em 12 de março de 1971, ficando prontas e inauguradas em janeiro de 1972.
Em março de 1971 o padre Antonio Maffei foi substituído pelo padre José Valle da mesma congregação, sendo sua posse no dia 16 de abril de 1972.